而在这种对垒的情况下，一些黑帮的人与NOD进行了秘密会谈，很快的双方勾搭了起来。随之而来的就是一大堆黑帮的标准差事——最终这个消息被传到GDI议会上时，这些黑帮分子已经在GDI控制区里造成了不小的麻烦了。但关于究竟是哪些黑帮在搞事这一点GDI短时间之内摸不着头绪，那就索性全揍一遍。反正黑帮的问题GDI早晚也是要去解决的，无非是早一点晚一点的区别罢了。
然后GDI给所有主要黑帮的领导人发去了最后通牒：要么放弃一切权力，要么洗干净脖子等死。
自然而然的，大部分黑帮领导人都对此呈一个乐观态度——在他们看来，GDI怎么敢真把他们都杀了的？只有一些有识之士见情况不妙抓紧开溜离开了GDI控制区或是上交了权力以求得保住性命，而剩下的那些人，他们很快就感受到了GDI的怒火。
而其中最具代表性的行动无疑是在纽约市的行动。在这座“罪恶都市”，GDI直接将三个有着完整编制的师级战斗单位从前线调回，并且将其投入纽约市的战场以表达GDI的态度。
纽约市的战斗持续了差不多两天，期间死伤人数超过十万。两天之后，纽约市里的黑帮基本上被清扫完毕，剩下的都是收尾工作。虽然这场全球规模的行动势必会造成极其严重的影响，但是GDI已经做足了准备。为了后方的稳固，这一切都是有必要的。
这场轰轰烈烈极其坚定的扫黑除恶行动不仅仅为之后的第二次泰伯利亚战争排除了隐患，还为日后蓝区良好的治安环境打下了基础。
但……都只不过是暴风雨前的宁静罢了。