突然，一阵刺耳的警报声响起。监控屏幕上，数百架日军飞艇正朝着重庆飞来，飞艇腹部投射出巨大的阴影——那阴影的轮廓，竟是之前被摧毁的魔神傀儡。燕茜蔓握紧凤凰玉佩，却发现玉佩表面浮现出陌生的符文，这些符文与她在南京看到的石棺纹路如出一辙。
“燕姑娘，小心身后！”林鹤轩的惊呼晚了一步，一道黑色锁链穿透燕茜蔓的左肩。顾修远踏着黑雾凌空而立，他的面容冷峻如冰，胸口的黑色心脏跳动时，整个重庆城的灯火都在明灭闪烁。“把玉佩交出来，燕茜蔓。”顾修远的声音毫无感情，“这是打开终章的钥匙。”
白衣少年突然挡在燕茜蔓身前，周身金光暴涨：“休想！当年我能封印邪神，现在也能...”他的话被顾修远的魔神虚影打断，虚影挥爪击碎了少年的护体金光。燕茜蔓强忍剧痛，将凤凰玉佩与破碎的罗盘碎片融合，一道耀眼的光芒迸发而出，时空再次扭曲。
当光芒消散，燕茜蔓发现自己身处一座陌生的图书馆。书架上堆满了记载着《破魔十二式》的古籍，而在书架尽头，坐着个戴着兜帽的老者。“你终于来了，破魔传人。”老者摘下兜帽，露出与初代宝甲主人相似的面容，“我是守护终章秘密的最后一人，现在，是时候告诉你真相了...”
话音未落，图书馆的窗户突然爆裂，无数机械飞虫涌入。老者抬手间，书架上的古籍化作金色光盾，然而光盾在接触飞虫的瞬间开始崩解。“记住，终章的关键不在过去，也不在未来...”老者将一本封皮写着“归零”的古籍塞给燕茜蔓，“而在...”他的声音被爆炸声淹没，整座图书馆开始坍塌。
燕茜蔓抱着古籍冲出废墟，却见天空中浮现出巨大的幽冥渊符文。顾修远的魔神虚影正在吸收整个城市的力量，而神秘女子和山本弘一站在虚影肩头，指挥着日军对重庆发动总攻。林鹤轩带着特别行动组残余成员赶来，每个人身上都带着时空穿越留下的伤痕。
“燕姑娘，我们该怎么办？”林鹤轩握紧符咒，眼中却闪过一丝迷茫。燕茜蔓翻开“归零”古籍，泛黄的纸页上只有一句话：“唯有斩断因果，方能重启轮回。”她抬头看向天空中顾修远的魔神虚影，突然想起长白山巅初代宝甲主人留下的预言——“若混沌之力失控，唯有以命为引，以血为祭，方能重启轮回。”
就在这时，燕茜蔓的凤凰玉佩突然发出刺目红光，古籍上的文字开始流动，在空中组成新的阵图。神秘女子似乎察觉到了危险，指挥魔神虚影向燕茜蔓发动致命一击。燕茜蔓闭上眼，将凤凰火、混沌之力与自身血脉尽数注入阵图。
阵图爆发的光芒照亮了整个重庆，时空开始剧烈震荡。燕茜蔓在光芒中看到了无数个平行时空的自己，每个时空都在上演不同的结局。当光芒消散，她发现自己回到了北平城初遇顾修远的那一天。雪地上，顾修远正对着她微笑，而远处的巷子里，神秘女子的珍珠耳环闪过一抹幽光...