与此同时，甄嬛也在宫中加强了防范。她重新布置了宫中的守卫，增加了巡逻的频次和人数，还在小皇子的宫殿周围设置了重重机关。她亲自参与机关的设计和布置，确保这些机关既能有效地阻止外敌入侵，又不会对宫中的正常生活造成影响。她还对小皇子宫殿的防御设施进行了全面检查和加固，更换了更坚固的门窗，增加了了望哨和暗哨。
她自己更是减少了外出，几乎时刻陪伴在小皇子身边，教导他读书识字，同时也向他传授一些应对危险的方法。她教小皇子如何识别危险信号，如何在危险来临时迅速找到安全的藏身之处，以及如何与侍卫配合保护自己。
“皇儿，若遇到危险，不要慌乱，立刻躲进密室，那里有侍卫保护你，知道吗？”甄嬛温柔而严肃地对小皇子说道。
小皇子懂事地点点头：“母妃，儿臣记住了。儿臣不会让您担心的。”小皇子虽然年纪小，但经过之前的种种事件，已经变得更加坚强和懂事，他深知自己身处的环境充满危险，必须学会保护自己。
然而，危险并未因此而推迟到来。一日深夜，宫中突然响起一阵尖锐的哨声，这是有外敌入侵的信号。甄嬛迅速起身，唤醒小皇子，带着他往密室走去。一路上，侍卫们与一群黑衣蒙面人展开了激烈的搏斗。这些蒙面人武艺高强，行动敏捷，显然是训练有素的杀手。他们手持利刃，招式狠辣，每一招都直奔侍卫的要害而去。
“保护好小皇子！”甄嬛大声喊道，同时自己也拿起一把长剑，与杀手们战斗起来。她虽为女子，但自幼习得武艺，此刻为了保护小皇子，更是拼尽全力。她身姿矫健，剑如游龙，在杀手群中穿梭，每一剑都带着凌厉的气势，逼退了不少杀手。
双方激战正酣，突然一名杀手趁乱朝着小皇子扑去。甄嬛心中大惊，不顾一切地冲过去，用身体挡住了杀手的攻击。杀手的利刃划过甄嬛的手臂，鲜血瞬间染红了她的衣袖。一阵剧痛袭来，但甄嬛咬紧牙关，强忍着疼痛，用力将小皇子推向密室的方向。
“母妃！”小皇子惊恐地呼喊。
“别管我，快走！”甄嬛强忍着疼痛，大声喊道。就在这时，大批增援的侍卫赶到，将杀手们团团围住。经过一番苦战，杀手们见势不妙，纷纷抛出烟雾弹，趁乱逃走。
甄嬛顾不上手臂的伤势，先将小皇子安顿进密室，确保他安全后，才让太医为自己诊治。太医为她包扎好伤口后，说道：“小主，您的伤势并无大碍，只是需好好调养，不可再劳累。伤口虽不深，但也需注意防止感染，按时服药换药。”
甄嬛微微点头，心中却在思索：“这些杀手必定是‘暗影盟’的人，看来幕后主使已经等不及要动手了。此次虽然击退了他们，但他们肯定还会再来，必须尽快找出幕后黑手，彻底解决这场危机。”
经过这次袭击，甄嬛明白，仅靠在宫中防范远远不够，必须主动出击。她让心腹大臣加大调查力度，不仅要从与“暗影盟”的往来入手，还要调查后宫中与“暗影盟”可能存在关联的人。同时自己也在后宫中展开秘密调查。她从与自己有过节的嫔妃入手，暗中观察她们的一举一动，留意她们与宫外人员的往来。她安排了多个眼线，密切关注这些嫔妃的日常行为，包括她们的信件往来、访客记录，甚至是饮食起居的细微变化。
在调查过程中，甄嬛发现贤妃近日行为十分可疑。她时常借口身体不适，闭门谢客，却又在深夜偷偷与一名神秘男子会面。甄嬛安排人跟踪那名神秘男子，发现他竟是“暗影盟”的一名堂主。每次会面，他们都选择在极为隐蔽的地方，周围还布置了不少暗哨，以防被人发现。
“看来贤妃嫌疑很大。继续跟踪，看能否找到她雇佣‘暗影盟’对付小皇子的证据。要小心行事，不能打草惊蛇。不仅要跟踪他们的会面，还要调查贤妃与‘暗影盟’之间是否有金钱往来，以及是否有传递相关指令的信件。”甄嬛吩咐道。
几日后，跟踪之人终于找到了关键证据。原来贤妃因嫉妒甄嬛受宠，小皇子又深得皇上喜爱，担心自己的儿子将来在皇位争夺中失利，便勾结“暗影盟”，企图暗杀小皇子。她与“暗影盟”堂主往来的信件被截获，信中详细描述了暗杀计划以及报酬的支付方式。信件中提到，贤妃承诺事成之后，会给“暗影盟”一大笔金银财宝，还会利用自己在宫中的势力为“暗影盟”提供庇护。
甄嬛拿着信件，心中愤怒不已：“好个贤妃，竟敢做出这等伤天害理之事。”她决定立刻面见皇上，揭露贤妃的阴谋。
在皇上面前，甄嬛将信件呈上，并详细讲述了事情的经过。皇上看后，龙颜大怒：“贤妃竟然如此狠毒，为了一己私欲，竟敢谋害皇子，实在是罪不可赦。来人，将贤妃打入冷宫，听候发落。同时，彻查贤妃宫中与此次阴谋有关的所有人，一个都不许放过。”
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