弘治、正德年间主要在河套活动的部落为达延汗部。
弘治年间，鞑靼部雄主达延汗统一蒙古诸部，拥众入据河套。
弘治元年（1488年）夏，达延汗奉书求贡，自称大元大可汗，一面与明通使，一面往来河套掠边。
弘治八年（1495年）土默特部首领火筛率众进入河套驻牧，弘治十三年（1499年），达延汗、火筛复居河套。
嘉靖时期，土默特部首领吉囊、俺答部在河套地区活动，成为明朝北部边界的主要威胁。
面对蒙古部族的袭扰，明军疲于应付。
而为了扭转局势，明朝开始商议主动出击，试图将蒙古赶出河套。
即所谓的“搜套”、“剿套”、“复套”。
搜套、剿套主要是指对河套的进攻。
复套则是指对河套的进攻，然后建立防守，屯田。
很显然，复套尤难。
成化元年（1465年）十月。
毛里孩部入寇陕西，自此之后无岁不入，杀掠人畜至数千百万。
吏科给事中程万里上疏建议：选京师骑兵一万，宣府、大同各一万，每三千人为一军，以骁将十人统率，探寻毛里孩所在，出其不意，昼伏夜行，捣其巢穴！
在成化二年（1466）。
大学士李贤亦主张搜套，但因为大臣反对，而未能成行。
成化八年（1472年）。
在时任兵部尚书白圭的极力主张下，明廷三次派大将抚宁伯朱永、武定侯赵辅、都督刘聚率军征讨，均无功而还。
成化九年（1473年），王越总制关中军务。
这年满都鲁、孛罗忽进犯秦州（今甘肃天水）。
王越侦知其老幼皆在榆林边外的红盐池（今神木县北红碱淖）。
遂率一万骑兵出榆林，两昼夜急驰八百里，突袭红盐池。
这一战取得不小的战果，斩三百五十级，获其牲畜，焚其营帐而返。
鞑靼见巢穴已成一片灰烬，于是远徙北去，不复居河套。
而为了统一加强西三边地区的御边力量。
明朝于弘治十年（1497年）设置三边总制。
开府固原，防秋驻花马池，以王越为首任三边总制。
到嘉靖四年（1525年）杨一清督陕时，这一职务与巡抚一样成为定制。
后在嘉靖十九年（1540年）改为总督，完成了由外派京官向地方官转化的过程。